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ChIP-Seq

染色質免疫共沉淀技術(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也稱結合位點分析法,是研究體內蛋白質與DNA 相互作用的有力工具,通常用于轉錄因子結合位點或組蛋白特異性修飾位點的研究。將ChIP 與第二代測序技術相結合的ChIP-Seq 技術,能夠高效地檢測全基因組范圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的DNA區段。

ChIP-Seq 的原理是:首先通過染色質免疫共沉淀技術(ChIP)特異性地富集目的蛋白結合的DNA 片段,并對其進行純化與文庫構建;然后對富集得到的DNA片段進行高通量測序。研究人員通過將獲得的數百萬條序列標簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的DNA 區段信息。


推薦平臺

Ilumina HiSeq2000、 Ion Proton




生物信息分析

1. 原始數據整理、過濾及質量評估 
2. ChIP-Seq序列與參考基因組序列的比對
3. Peak Calling(統計每個樣品的Peak片段信息)
4. Peak Annotation(根據已有的基因組數據庫注釋信息獲得所有Peak位點信息)
5. Motif預測、基因集分析
6. 全基因組范圍的峰值分布
7. 樣品間差異Peak分析
8. 基因組水平和感興趣區域的數據可視化


派森諾的優勢

1.根據實際需求可個性化定制測序及分析方案。

2.嚴謹的實驗流程和可靠的檢測結果,保證數據分析結果準確可信。

3.分析結果的圖表參考國際頂級期刊設計,可直接用于文章寫作。

4.與轉錄組等數據進行聯合分析,深度挖掘生物信息資源。


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